Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDSS1Q5T2R2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms