Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms