Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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