Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF1Q3BBV0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms