Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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RTN1Q16799 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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RTN1Q16799 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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RTN1Q16799 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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RTN1Q16799 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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