Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP2Q16527 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP2Q16527 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP2Q16527 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP2Q16527 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP2Q16527 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSRP2Q16527 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP2Q16527 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms