Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA2Q15822 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms