Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP4Q15650 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms