Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms