Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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