Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ITGA9Q13797 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA9Q13797 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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