Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4BQ13620 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4BQ13620 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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