Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SGCGQ13326 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SGCGQ13326 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SGCGQ13326 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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SGCGQ13326 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SGCGQ13326 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SGCGQ13326 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SGCGQ13326 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SGCGQ13326 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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