Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTGDRQ13258 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTGDRQ13258 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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