Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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