Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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