Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOBRQ0VD83 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBRQ0VD83 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms