Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms