Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms