Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE4BQ07343 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms