Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms