Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CD226-207ENST00000582621 1458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AL390835.1-201ENST00000413941 901 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 IL12A-AS1-201ENST00000462431 988 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LINC00648-204ENST00000557749 443 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TNP2Q05952 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms