Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP7AQ04656 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP7AQ04656 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms