Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OC90Q02509 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OC90Q02509 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms