Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTUD4Q01804 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms