Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXC5Q00444 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXC5Q00444 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms