Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms