Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UFM1P61960 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UFM1P61960 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UFM1P61960 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UFM1P61960 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms