Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S2P56377 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S2P56377 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms