Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERFP50548 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERFP50548 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERFP50548 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERFP50548 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERFP50548 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERFP50548 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERFP50548 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERFP50548 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERFP50548 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERFP50548 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERFP50548 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERFP50548 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERFP50548 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms