Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms