Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCLMP48507 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCLMP48507 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms