Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5OP48047 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms