Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms