Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5AP29375 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms