Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA3P25788 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms