Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APCP25054 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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APCP25054 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APCP25054 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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APCP25054 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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APCP25054 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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APCP25054 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
APCP25054 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
APCP25054 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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APCP25054 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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APCP25054 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APCP25054 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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