Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPREP23469 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPREP23469 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPREP23469 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPREP23469 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPREP23469 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPREP23469 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPREP23469 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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