Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRBP23467 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms