Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms