Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAV1P15498 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAV1P15498 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAV1P15498 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAV1P15498 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAV1P15498 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms