Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFTRP13569 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFTRP13569 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CFTRP13569 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFTRP13569 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFTRP13569 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFTRP13569 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFTRP13569 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFTRP13569 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFTRP13569 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFTRP13569 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFTRP13569 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFTRP13569 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms