Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TOP2AP11388 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms