Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHGAP10645 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHGAP10645 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHGAP10645 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHGAP10645 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHGAP10645 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHGAP10645 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHGAP10645 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHGAP10645 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHGAP10645 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHGAP10645 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHGAP10645 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms