Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTNP04004 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTNP04004 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTNP04004 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTNP04004 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTNP04004 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTNP04004 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTNP04004 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VTNP04004 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VTNP04004 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VTNP04004 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms