Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms