Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CALUO43852 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALUO43852 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALUO43852 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms