Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms