Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HOXA3O43365 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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HOXA3O43365 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HOXA3O43365 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HOXA3O43365 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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