Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP290O15078 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP290O15078 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP290O15078 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP290O15078 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP290O15078 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP290O15078 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP290O15078 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP290O15078 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP290O15078 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP290O15078 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP290O15078 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP290O15078 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP290O15078 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP290O15078 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP290O15078 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP290O15078 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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CEP290O15078 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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CEP290O15078 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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CEP290O15078 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP290O15078 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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CEP290O15078 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP290O15078 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP290O15078 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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CEP290O15078 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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CEP290O15078 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP290O15078 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP290O15078 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP290O15078 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP290O15078 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP290O15078 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP290O15078 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP290O15078 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CEP290O15078 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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CEP290O15078 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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